Amb programari lliure es disposa del control total de les teves dades i aplicacions, ja que aquest programari pot analitzar-se i modificar-se tal i com ho desitgis. Aquestes modificacions les pot realitzar qualsevol proveïdor de desenvolupament de programari que tingui coneixements del llenguatge del codi font.
Cada vegada hi ha més empreses especialitzades en programari lliure, i això dóna una nova avantatge per poder triar el proveïdor que es cregui més convenient.
La transparència del programari lliure és una garantia a la seguretat de totes les empreses i administracions públiques, que a més s'estalvien els costos de llicències d'unes aplicacions que poden ser manipulades per tercers.